Protiv rešenja inspektora može se izjaviti žalba u roku od 15 dana od dostave pisanog rešenja. Ulaganje žalbe ima odložno dejstvo (odlaže izvršenje rešenja), ali ne uvek: žalba NE odlaže izvršenje rešenja kojim se nalažu hitne mere radi sprečavanja ili otklanjanja opasnosti po život/zdravlje ljudi, imovinu, prava i interese zaposlenih, privredu, životnu sredinu, biljni/životinjski svet, javne prihode, nesmetan rad organa, komunalni red ili bezbednost — što se posebno obrazlaže u rešenju.
ZIN propisuje i da je drugostepeni organ dužan da sam reši stvar ako ponovo poništi prvostepeno rešenje inspektora u istoj stvari (kada inspektor u ponovljenom rešenju nije uvažio stav drugostepenog organa) — tada ne vraća predmet inspekciji, nego sam meritorno rešava; ovo pravilo štiti nadzirane subjekte.
Na ostala pitanja u vezi sa žalbom primenjuju se pravila ZUP-a. Odluka drugostepenog organa po žalbi je konačna i protiv nje se može pokrenuti upravni spor u skladu sa Zakonom o upravnim sporovima (ZUS).