Odnos organa državne uprave sa drugim državnim organima obuhvata odnose sa sudovima, javnim tužilaštvima i drugim državnim organima. Odnos sa javnim tužilaštvima je odnos saradnje, a odnos sa sudovima može biti odnos saradnje ili sudska kontrola odluka državne uprave.
Odnos sa drugim državnim organima podrazumeva odnos sa organima koji imaju status nezavisnih tela. Ta nezavisna tela vrše određene zakonodavno-kontrolne funkcije i funkcije izvršne vlasti stručnog karaktera, ali su nezavisna od uticaja politike i izvršne vlasti; organe rukovođenja u njima bira Narodna skupština i oni njoj odgovaraju.
Nezavisna tela osnivaju se Ustavom (Zaštitnik građana, Državna revizorska institucija) ili posebnim zakonom (Agencija za borbu protiv korupcije, Poverenik za informacije od javnog značaja i zaštitu podataka o ličnosti). Osnovna karakteristika njihovog odnosa sa organima državne uprave je specifična kontrola rada organa državne uprave od strane tih nezavisnih organa.