Organi državne uprave su ministarstva, organi uprave u sastavu ministarstava i posebne organizacije. Ministarstvo se obrazuje za poslove državne uprave u jednoj ili više povezanih oblasti; broj, naziv i nadležnosti utvrđuju se Zakonom o ministarstvima (Zakonom iz 2020, izmenjenim 2022, obrazovano je 25 ministarstava). Broj i nadležnosti se menjaju zbog političkih faktora i razvoja poslova.
Organi uprave u sastavu ministarstava obavljaju inspekcijske poslove (npr. Inspekcija rada) ili izvršne poslove sa autoritetom vlasti (npr. Poreska uprava); imaju veću samostalnost od sektora, ali ne mogu donositi propise ni učestvovati u oblikovanju politike Vlade. Posebne organizacije obrazuju se za poslove uže stručnog karaktera i imaju veći stepen samostalnosti od organa u sastavu; obrazuju se Zakonom o ministarstvima ili posebnim zakonom.
Službe Vlade nisu organi državne uprave i Zakon o državnoj upravi ih ne poznaje; predviđene su Zakonom o Vladi i osnivaju se za stručne ili tehničke poslove za potrebe Vlade (npr. Generalni sekretarijat) ili za poslove zajedničke više organa. One ne vrše poslove državne uprave, već stručne poslove neophodne da bi se ti poslovi obavljali — organi državne uprave pružaju usluge ka spolja (građanima), a službe Vlade ka unutra (državi). Osnivaju se uredbom Vlade.