Evropska komisija je izvršni organ Evropske unije, svojevrsna Vlada EU. Uz Evropski parlament i Savet predstavlja jednu od tri glavne institucije koje upravljaju Unijom. Komisija ima pravo da daje nacrte zakona i predstavi ih Parlamentu i Savetu; kao izvršno telo, odgovorna je za implementiranje evropskog zakonodavstva (direktive, regulacije, odluke), budžeta i programa; ponaša se kao čuvar postupaka i, zajedno sa Sudom pravde, uverava se da se pravo Zajednice pravilno primenjuje; i predstavlja Uniju na međunarodnoj sceni.
Komisija EU ima 28 komesara; među njima se biraju predsednik i potpredsednici. Kandidate za komesara predlažu vlade država članica, a za njihov izbor neophodna je saglasnost Evropskog parlamenta; mandat komesara traje pet godina. Komisija se razlikuje od drugih institucija po tome što jedino ona ima zakonodavnu inicijativu — samo Komisija može podnositi formalne predloge zakonodavnih akata (osim u oblasti zajedničke spoljne i bezbednosne politike, gde deli pravo sa Savetom).
Po Ugovoru iz Lisabona, građani EU mogu tražiti od Komisije da predlaže zakonodavne akte putem peticije sa bar milion potpisa, ali takvi zahtevi nisu obavezujući. Komisija je predložila mnogo propisa zasnovanih na principu predostrožnosti (usvajanje propisa ako postoji razumna sumnja na opasnost po okolinu ili zdravlje), čime je postala svojevrsni regulator svetskog tržišta. Sedište Evropske komisije je u Briselu.