Prekršajni postupak je u osnovi sudski postupak — o pravima i dužnostima građana, posebno o kažnjavanju, odlučuje samo sud. Postupak je funkcionalan i ekonomičan i usklađen s Evropskom konvencijom o ljudskim pravima. Unapređenja obuhvataju: prekršajnu odgovornost pravnih lica, rad u javnom interesu, rokove zastarelosti, teret dokazivanja na podnosiocu zahteva, dostavljanje, prekršajni nalog, sporazum o priznanju prekršaja i jedinstvene registre.
Prekršajni postupak pokreće se rešenjem suda. Tokom postupka vrši se saslušanje okrivljenog, sprovode radnje dokazivanja (saslušanje svedoka, uviđaj, veštačenje, izvođenje dokaza) i druge radnje. Postupak se završava presudom ili rešenjem suda.
Faze su: (1) iniciranje postupka (prethodni postupak) — izdavanjem prekršajnog naloga ili podnošenjem zahteva za pokretanje (po prijavi ili po službenoj dužnosti); (2) pokretanje postupka — rešenjem suda; (3) saslušanje i dokazivanje; (4) presuda/rešenje; potom žalbeni postupak i vanredni pravni lekovi; i izvršni postupak (presuda/rešenje izvršavaju se po pravilu kad postanu pravnosnažni).